Конечно, в воздушном охлаждении двигателя, по сути, нет чего-то плохого, наоборот, владельцы «Запорожцев» в процессе эксплуатации своих транспортных средств не сталкивались с систематическими протечками в системах охлаждения, которые присутствовали в советских автомобилях, относящихся к до «жигулёвскому» времени. Помимо этого, владельцам ЗАЗ с наступлением холодов не нужно было возиться с горячей водой или находить, а затем очень бережно хранить антифриз, который в те времена был достаточно большим дефицитом.

И всё было просто прекрасно, в том случае, если у «Запорожца» не начинал перегреваться двигатель. По рассказам создателя и разработчика этой без сомнения легендарной советской машины, перепалки между мотористами и кузовщиками начались ещё во время доводки ЗАЗ-966. И эти перепалки происходили как раз из-за систематического перегрева двигателя. Кузовщики даже как-то раз приваривали к задним крыльям две половины разрезанного ведра. Сделали они это для того, чтобы показать, что даже уши такого большого размера не помогут избавиться от перегрева двигателя. Нужно сказать, что до конца решить данную проблему производителю так и не удалось.     

На ЗАЗ-966, получившего название «тридцатка» за то, что на нём устанавливался 0,9 литра с мощностью 30 лошадиных сил, охладительная система вообще функционировала вопреки законам физики. Ведь к нагретому двигателю вентилятор, присутствующий в конструкции системы охлаждения, подвал разряженный, но при этом горячий воздух, проходящий через раскалённые рёбра гильз, затем уходил в кожух и только после этого выходил наружу под номерным знаком.

Владельцы автомобилей «Запорожец» использовали самые разнообразные идеи для решения этой проблемы, например, выполняли наращивание «ушей» при помощи самодельных конструкций. Довольно часто «Запорожцы», оснащённые самодельными ушами, можно было встретить в южных района Советского Союза, где на автомобилях ездили, ещё и немного приоткрывая капот. На самом деле исключить данную проблему владелец автомобиля мог, проведя тонкую и грамотную настройку зажигания, а также карбюратора, так как все «Запорожцы» были к этому довольно чувствительны. Однако далеко на каждый владелец этого автомобиля обладал необходимыми знаниями и опытом, для того чтобы выполнить подобную настройку.

На моделях, оснащаемых двигателем 1,2 литра и мощность 40 лошадиных сил, вентилятор начал подавать к нагретым элементам холодный воздух, после чего надёжность и функциональность системы существенно возросла. Однако даже после этого автомобиль продолжил оставаться довольно чувствительным к настройкам. Так, например, после проведения грамотной регулировки начинал меньше тарахтеть двигатель. Помимо этого, качество работы охладительной системы напрямую зависело от чистоты двигателя.